Skogsgenetisk ordlista
Ordlistan utgör en sammanfattning av viktiga fackuttryck inom skogsgenetiken. De engelska uttrycken har ibland givits inom parantes, i vissa fall saknas vedertagna svenska termer, isåfall ges bara den engelska termen. Ordlistan är mer omfattande än vad som behövs för kompendietexten för grundkurs i skogsgenetik i Umeå. För grundkursen fordras bara kännedom om termer som förklaras i kompemdietexten.
Adaptation,
processen att bli anpassad.Additiv genverkan, till den del genernas verkan kan adderas betecknas detta som additiv genverkan.
Additiv varians, (additive variance) förädlingsvärdenas varians, den additiva variansen är den för urvalsförädling tillgängliga genetiska variansen.
Allel, en av två eller flera former av en gen som förekommer i ett lokus; är allelernas antal större än två bildar de att system av multipla alleler. Varje kromosom innehåller endast en av allelerna.
Allmän kombinationsförmåga, (GCA, general combining ability), en individs värde grundat på dess avkommors medelvärde om de paras med resten av populationen.
Anpassning, är graden med vilken en individ kan leva och fortplantas under bestämda miljöförhållanden, den ställs alltid i relation till andra individer av samma art.
Artificiell korsning, honblommor isoleras innan de är receptiva för att förhindra pollinering med okänt pollen. När de är receptiva besprutas honblommorna med känt pollen.
Avelsvärde = förädlingsvärde, (breeding value, BV). Värdet av en individ som förälder, den del av en individens genotyp som är oberoende av andra delar och därför additiv och överförbar. Avelsvärdet är dubbla allmänna kombinationsförmågan.
Avkommeprövning Syftar ofta på att man bedömmer ett plusträd på grundval av dess avkomma.
Beståndsfrö, Frö som insamlats i skogsbestånd, sätt ofta i motsats till "förädlat frö" från fröplantage.
Blomningsstimulering, Metoder för att få träd att blomma tidigt och rikligt. Torkstress, värmebehandling och hormoninjektioner är metoder som prövats.
Centromer, ett område på kromosomen som är väsentligt för kromosomrörelserna under mitosen och meiosen.
Diallela korsningar, ett korsningssschema där två eller flera föräldrar korsas med varandra på alla tänkbara sätt, varje förälder tjänstgör således både som mor och far samt självpollineras.
Dihybrid korsning, korsning mellan två individer som är heterozygota för generna i två olika loci.
Diploid, (2n), en individ med två homologa kromosomuppsättningar.
Dominans, samspel mellan alleler på homologa loci, graden av heterozygotens avvikelse från medelvärdet av respektive homozygoter.
Dominant, den av allelerna hos en heterozygot som i högre grad sätter sin prägel på individen än den andra allelen, som då betecknas som recessiv; om A är dominant över a kommer AA och Aa att ha samma fenotyp.
Ekoklin, ärftlig anpassning längs en miljögradient.
Ekotyp, grupp av individer inom en art som har en viss ärftligt anpassning till en bestämd ståndort.
Epistasis, samspel mellan gener i olika loci.
Eukaryot, en organism vars celler, till skillnad från bakterier, innehåller en cellkärna och embranbundna organeller. Svampar, alger, protozoer, högre växter och djur är alla eukaryoter.
Exon, se gen.
F1-generation, avkommor efter korsning mellan två föräldrar, avkommor efter korsningar mellan F1-individer betecknas som F2 osv. F står för filial generation.
Fenologi, ungefär "årsrytm".
Fenotyp, summan av en viss genotyps egenskaper vid ett visst tillfälle. Fenotypen utgör genotypens reaktion med miljön; fenotyp = genotyp + miljö.
Fertilitet, en individs förmåga att få avkomma.
Fitness, ett uttryck för en individs bidrag till nästa generation.
Fixering av alleler, när endast en allel finns kvar i en population trots att det fanns flera från början.
Fotoperiod, daglängd, den ljusa delen av dygnet; motsatsen = nattlängd.
Fotoperiodisk reaktion, är en typ av förändringar som initieras av förändringar i förhållandet daglängd/nattlängd.
Fri avblomning, (open pollination, wind pollination) pollinering som sker utan mänsklig påverkan, kan inkludera självpollinering.
Fröplantage, anläggning för att producera genetiskt högvärdigt frö.
Fylogeny, den evolutionära historien av en grupp organismer eller gener.
Fytotron, en serie klimatkamrar i vilka olika miljöfaktorer såsom daglängd, ljusintensitet, temperatur och luftfuktighet kan regleras.
Förädlingsvärde = avelsvärde, se detta ord.
Gamet, könscell (gameterna är haploida).
Gen, arvsanlag, den enhet som överför information från en generation till nästa; utgör ett DNA-segment av en kromosom; många gener består av 1) kodande sekvenser (exoner) som översätts till protein, 2) mellanliggande icke-kodande sekvenser (introner) 3) en reglerande del (promotor) som möjliggör översättningen (transkriptionen) och 4) änd- (stopp) sekvenser. Genen kodar ofta för en biokemisk funktion.
Genbank, samling av genotyper; pollenbank, fröbank, vävnadsodlingsbank, klonarkiv, genetiskt försök; bestånd, som har som en huvuduppgift att bevara genetiska resurser. Även administrativa funktioner för bevarande av genresurser ingår i genbanksbegreppet.
Genekologi, läran om samspelet mellan genotyp och miljö.
Genetisk drift leder till slumpmässiga ändringar av genfrekvenser och fixering av alleler i små populationer.
Genetisk gallring, borttagning av genetiskt underlägsna individer från en fröplantage.
Genetisk struktur, fördelningen av den genetiska variationen mellan och inom populationer.
Genetisk vinst, genomsnittlig förbättring av avkomman jämfört med ursprungspopulationen.
Genflöde, individer från en population med en genfrekvens som skiljer sig från den i en annan population deltar i genereringen av avkomman i den andra populationen.
Genfrekvens, den frekvens med vilken en viss gen förekommer i en population, genfrekvenser uttrycks vanligen som fraktioner av 1.
Genom, (uttal genóm) kromosomuppsättning, könsceller hos diploida organismer
har ett genom, polyploida arter har fler än två genom.
Genotyp, den ärfliga konstitutionen; ofta används termen för förhållandet i ett enstaka lokus, men kan också avse den totala effekten av en individs gener på en viss egenskap.
Genotyp x miljösamspel, något förenklat innebär det att olika genotyper ändrar rangordning från en miljö till en annan.
Genteknik innefattar olika tekniker för att i laboratoriet studera DNA och/eller RNA- molekylerna för att få information om genernas struktur, funktion och hur de regleras samt överföring av gener mellan olika individer av samma eller olika arter.
Grundstam, planta som används vid ymp-produktion. På grundstammen ympas en kvist från ett plusträd.
Halvsyskonfamilj, plantor med samma moder men olika fäder, tex skörd från ett enstaka träd.
Helsyskonfamilj, plantor med samma mor och far, vanligen resultat av en kontrollerad korsning.
Haploida kromosomtalet (n), antalet kromosomer i en haploid cell. Könscellerna är haploida; barrträdens sk frövita är en haploid vävnad.
Hardy-Weinbergs lag , ger genotypfrekvenserna som förväntas hos en population efter en generation av slumpmässig parning, genotypfrekvenser som funktion av genfrekvenser för en population i jämvikt.
Heritabilitet, betecknas med h2 och är definitionsmässigt additiv varians/fenotypisk varians. Heritabiliteten för en viss egenskap utgör en skattning av överensstämmelsen mellan besläktade individer och antar värden mellan 0 och 1.
Heterosis, förekomst av ökad storlek och vitalitet hos hybrider jämfört med föräldrarna eller föräldrapopulationen.
Heterozygot, individ som bildar mer än ett slags könsceuer beroende på att samma
lokus hos ett par homologa kromosomer innehåller olika alleler.
Homologa kromosomer, kromosomer som är identiska ifråga om storlek, form och locus, men där allelerna kan vara olika så att t ex A finns i den ena homologen medan a finns i den andra. Diploida organismer har par av homologa kromosomer.
Homozygot, förekomst av samma alleler i samma lokus hos homologa kromosomer.
Hybrid, avkomma efter korsning mellan ärftligt olika föräldratyper (det kan röra sig om olika arter, olika raser, eller olika förädlingslinjer).
Hybrid-DNA, består av en DNA-molekyl som framställts i laboratoriet genom att sammansmälta DNA-sekvenser som normalt inte hör samman.
Härkomst, varifrån ett material kommer.
Inavel, (inbreeding) korsning mellan besläktade individer eller självbefruktning.
Inavelsdepression, nedsättningen av vitaliteten efter inavel.
Inavelskoefficient, (F) är en skattning av sannolikheten att två alleler i samma locus i de båda homologa kromoserna i en individ är identiska genom arv, dvs härstammar från en och samma gen hos en gemensam förfader.
Inkompatibilitet, hinder för korsning mellan två individer så att befruktningen uteblir. Termen används även för att beteckna att sammanväxning av ympkvist och underlag ej kommer till stånd av biologiska skäl.
Isozymer (även isoenzymer eller allozymer), enzym som finns i flera molekylärt olika former men med likartad funktion.
Klin, ärftlig anpassning längs en miljögradient.
Klon, genetiskt identiska individer åstadkomna genom vegetativ förökning-, ympar, sticklingar, rotskott.
Kodon, en sekvens av tre nukleotider som bestämmer vilken aminosyra som skall inkorporeras vid en viss plats i proteinkedja eller specificerar slutet på translation.
Koppling, innebär att generna inte nedärvs oberoende av varandra utan som om de vore kopplade, vilket beror på att de är belägna på samma kromosom; ju kortare avståndet är mellan två gener desto starkare koppling.
Korsbefruktning, motsats till självbefruktning, korsning mellan icke besläktade individer.
Kritisk nattlängd för knoppsättning, den nattlängd vid vilken 50 % av plantorna i ett material bildat toppknopp.
Kromatid, dotterhalva av kromosom.
Kromosom, (eg. färgkropp) bärare av arvsanlagen, dess DNA har förmåga till exakt självreproduktion; förekommer i cellkärnan, eller i cytosolen under vissa stadier av mitosen. De DNA-strängar som förekommer i mitokondrier och kloroplaster är enklare strukturellt.
Kvantitativ genetik. Syftar huvudsakligen på mätningar, relationer mellan, förutsägelser av eller ändringar i kvantifierbara egenskaper ur genetisk synpunkt (exempelvis avelsvärde, heritabilitet, genetisk korrelation, inavel, släktskap).
Kvantitativ nedärvning, gener i många loci påverkar egenskapen, varje gen har en ringa påverkan.
Locus (plural loci), bestämd position (ställe) på en kromosom där en gen är belägen.
Maternell effekt, den del av moderns påverkan som inte kan tillskrivas överföring av moderns nukleära gener till avkomman. Frövikt kan vara maternellt betingad.
Massförökning, för att skogsträdsförädlingens frukter skall komma till praktiskt utnyttjande måste det förädlade materialet massförökas. Detta sker sexuellt i fröplantager, men också vegetativt med sticklingar eller i framtiden vävnadskulturer.
Meios eller reduktionsdelning, den celldelning som leder till bildning av de haploida könscellerna.
Mendels lagar, förklarar uppkomsten av bestämda kategorier med bestämda frekvenser av individer med specifika egenskaper. Lagarna gäller för såväl kvalitativ nedärvning som kvantitativ nedärvning men är vanligen omöjliga att upptäcka för de senare.
Mitokondrie, en organell, ca 1-3 µm x 1 µm, som finns i alla eukaryota celler. Mitokondrierna är energifabriken i cellen och innehåller bl a enzymer för de slutliga reaktionerna med vilka organiska material oxideras till koldioxid och vatten. DNA-strängarna i mitokondrierna innehåller ca 60 gener.
mRNA (messenger RNA), den information som finns lagrad i DNA översätts via transkription till mRNA som i sin tur, via translationen, för informationen vidare till ett protein.
Molekylär klocka, hypotesen att i en viss gen ansamlas mutationer med ungefär samma hastighet under evolution så länge genen inte ändrar sin funktion.
Multipla alleler, se allel.
Multiple Population Breeding System (MPBS), genresurspopulationen delas upp i ett antal underpopulationer, som utsätts för olika urval.
Mutation, plötslig ärftlig förändring; kan bero på en strukturell kromosomförändring eller kemisk förändring i DNA.
Naturligt urval förutsätter att det finns en ärftligt betingad fenotypisk variation som ger olika anpassning, vilket leder till att avkomman skiljer sig genetiskt från föräldragenerationen.
Parcell, den minsta självständiga försöksenheten.
Plasticitet, den fenotypiska plasticiteten utgör den amplitud samma genotyp, familj, population, proveniens uppvisar under olika odlingsförhållanden; Den evolutionära (genetiska) plasticiteten ger möjlighet till framtida evolution.
Plastid, en organell i växtceller som genom fotosyntes bildar och/eller förvarar bl a kolhydrater. Plastider som innehåller den gröna pigmenten klorofyll kallas för kloroplaster och utför fotosyntesen. DNA-strängarna i plastiderna innehåller ca 120 gener.
Plusträd, utvalt träd med överlägsen fenotyp.
Polycross, artificiell pollinering med en blandning av pollen.
Polyploid, organism med mer än två kromosomuppsättningar.
Polyploidi, förekomst av en serie olika kromosomtal, som utgör multipler av ett tal (grundtal).
Population, vanligen en samling individer frän ett avgränsat område och som har en viss grad av anpassning till sin växtplats. Notera att population ofta avser en grupp som förädras över tiden.
Populationsgenetik. Fokuserar på gen- och genotyp frekvenser i populationer och deras ändringar.
Proveniens, population eller grupp av individer av samma art förekommande inom eller härstammande från ett med större eller mindre noggrannhet angivet område.
Receptivitet, mottaglighet, det stadium hos en blomställning eller enskild blomma då denna är mottaglig för pollen.
Recessiv, allel som kommer till uttryck endast i homozygot form; döljs i närvaro av dominant allel.
Reciproka korsningar, omkastning av fader och moder; korsningen A x B är reciprok till B x A (modern sätts vanligen först i denna typ av uttryck).
Recurrent selection, se upprepat urval.
Regulatorgen, en gen som reglerar en annan gens aktivitet. Många regulatorgener kodar för transkriptionsfaktorer, vilka är proteiner som binder till promotorområdet och påverkar hur aktivt genen transkriberas till mRNA.
Repetitivt DNA, innebär att vissa sekvenser av DNA återkommer många gånger i det haploida genomet, t o m upp till en miljon gånger och utgör hos barrträdsarterna 70-80 % av det totala DNA.
Ribosom, en cellulär partikel, bildad av proteiner och RNA, där mRNA translateras till protein.
RNA (ribonukleinsyra), utgör arvssubstansen hos de flesta växtvirus. Dessutom spelar RNA stor ron vid proteinsyntesen hos alla celler. Messenger RNA (mRNA), transfer RNA (tRNA) och ribosomal RNA (rRNA) är tre typer av RNA som är verksamma vid proteinsyntesen.
Selektionsdifferential, skillnaden mellan medelvärdet i den utvalda delen av en population och utgångspopulationens medelvärde.
Selektionsintensitet Selektionsdifferentialen uttryckt i utgångspopulationens standardavvikelse.
Självfertilitet, självbefruktning ger upphov till en avkomma.
Självpollinering, innebär att pollen från den egna individen ombesörjer pollineringen.
Självsterilitet, oförmåga att ge en avkomma vid självbefruktning.
Skräp-DNA, DNA som förmodligen saknar funktion.
Specifik kombinationsförmåga, innebär att vissa par av föräldrar vid samkorsning ger en avkomma som starkt avviker, positivt eller negativt, från vad förväntar med ledning av deras allmänna kombinationsförmåga (se detta ord).
Strobilus, blomställning.
Termoperiod, en under dygnet regelbundet växlande temperatur (t ex 20° C dagtemperatur och 10°C nattemperatur).
Tetraploid, (4n) en individ med fyra homologa kromosomuppsättningar.
Transgen växt, till växten har överförts en gen med hjälp av genteknik.
Transkription, innebär den process då den information som finns lagrad i en DNA-sekvens överförs till mRNA.
Translation, är den process då RNA översätter sin information till ett protein, vilket sker på ribosomerna.
Transposon, i vid bemärkelse, en DNA sekvens som kan replikeras och flyttas inom genomet.
Triploid, (3n), en individ med tre homologa kromosomuppsättningar.
Upprepat urval, återkommande urval som ingår i ett cykliskt förädlingsprogram.
Ursprung
Zygot, cell som bildas genom sammansmältning av en äggcell och en pollencell.
Den här sammanställningen har gjorts av Dag Lindgren 1999-07-18, men många formuleringar är tagna från olika tidigare ordlistor.